高研院根据学校对其作为北航高水平人文通识教育平台、高水平文科建设特区要求，立足学校理工文医综合交叉和文科精品战略，着重发展与学校定位双一流、更加卓越化目标相配合的人文基础学科和新文科。经过多年的建设和融合，建立了一支专职教师30余人、专兼结合近60人的师资队伍。2022年4月20日经学院党委会、党政联席会决定，根据学科、人才培养、课程组织和智库一体化建设的标准，正式成立以下五个内设机构。2024年8月根据学校要求进行了相应调整。
一、哲学系
主任：于金龙 名誉主任：李成智
副主任：顾家宁、盛珂、王妍
本系拥有一级学科硕士点，包括：中国哲学、科技哲学、马克思主义哲学、外国哲学四个二级学科方向。
部分老师担任法学院、公共管理学院博士生导师，招收博士生。
下设：
1.中国哲学研究所
所长：盛珂、顾家宁
成员：刘后滨、李静、罗旻、李丽珠、王硕
2.马克思主义哲学和外国哲学研究所
所长：康子兴
副所长：戴蓓芬
成员：周晓刚、陈绮
3.科技哲学研究所
所长：王妍
名誉所长：徐治立
副所长：和鸿鹏
成员：于金龙、韩连庆、叶山岭、王晶金
二、新闻、文化传播与管理系
主任：孙琳琳
副主任：段颀、杨扬、陈思
成员：孙琳琳、张家骥、段颀、陈绮、陈思、杨扬、何静、高泽晋、金文恺
下设
1.大数据与新闻传播研究所
成员：杨扬、高泽晋、金文恺
2.文化政策与法律研究所
成员：张家骥、余成峰
3.文化经济与管理研究所
成员：孙琳琳、蔡劲松（兼）、段颀、陈思
4.数字出版研究院
成员：龙卫球（兼院长）、孙琳琳（兼执行院长）、张新新
本系拥有文化传播与管理交叉学科硕士点（新文科）。
部分老师担任法学院、公共管理学院博士生导师，招收博士生。
三、古典与区域文明研究中心（北航通识教育中心）
主任：刘后滨
副主任：顾家宁（兼）、康子兴（兼）、周晓刚
成员：盛珂（兼）、余成峰（兼）、韩连庆（兼）、叶山岭（兼）、李静（兼）、罗旻（兼）、张家骥（兼）、陈绮（兼）、戴蓓芬（兼）、李丽珠（兼）、王硕（兼）
具体负责组织：
1.中国文明文化史课程组（刘后滨、顾家宁、盛珂、李静、罗旻、李丽珠、王硕）
2.世界文明文化史课程组（康子兴、余成峰、戴蓓芬、陈绮、张家骥、周晓刚）
3.科技哲学与科技史课程组（韩连庆、叶山岭、和鸿鹏、王晶晶）
4.其他通识（哲学、经济学、文传、法律等）课程组（龙卫球、于金龙、孙琳琳、段颀、陈思、杨扬、高泽晋、金文恺）
该中心主要负责全校本科生和文科大类的核心通识课程和人文素养选修课程，择机筹建文史及国际关系等学科。
四、科技治理中心
名誉主任：龙卫球
主任：余成峰
副主任：张家骥、和鸿鹏、何静
成员：王妍（兼）、于金龙（兼）、孙琳琳（兼）、韩连庆（兼）、段颀（兼）、王晶金（兼）、金文恺（兼）、高泽晋（兼）
本中心围绕人工智能等新兴科技发展和应用，面向国家治理重大战略需求，通过交叉融合形成高水平研究基地与智库，同时也培养这一领域的新型高层次复合人才。目前与法学院等合作筹设二级交叉博士点，具体包括科技治理与法律、科技伦理与治理、数字经济与法律三个方向。
五、实践教学中心
主任：孙琳琳
副主任：陈思（负责实习和社会课堂）、杨扬（知行书院工作部联络人）、何静（负责实验室、科教协同平台）、张晓明（负责毕业大戏和文艺实践）